三联书店海淀分店位于清华大学同方科技大厦。这里文化氛围浓郁，周边林立着清华、北大、北京林业大学、中国地质大学等二十多所高校，不远处坐落着京城另一家著名的学术书店——万圣书园。海淀分店的内部面积有900平米，其中图书区域500多平米。书店内部呈长方形，一端被设计成有创意的阶梯式空间，另一端是咖啡、甜品和简餐售卖处，中间的狭长区域则摆放着琳琅满目的书，其中主要是人文社科类图书。
